Atatürk Üniversitesi Biyofizik bölümünün misyonu, öğrencilere biyofizik alanında güçlü bir temel sağlamak ve onları bu alanda uzmanlaşmış bireyler haline getirmektir. Aynı zamanda toplumun sağlık ve bilimsel gelişmelere olan ihtiyacını karşılamak için araştırmalar yaparak bilgi üretmek de önemli amaçlarından biridir.

Vizyonu ise, biyofizik alanında ulusal ve uluslararası düzeyde saygın bir konumda olmak ve bu alanda yapılan çalışmalara liderlik etmektedir. Bölümün vizyonu, öğrencileri ve personeli için mükemmelliği teşvik ederken, sağlık bilimleri ve teknolojisindeki gelişmeleri takip ederek bunların toplumun yararına kullanılmasını sağlamaktır.

Temel değerleri arasında akademik mükemmellik, sürekli öğrenme, etik değerlere saygı, takım çalışması ve topluma hizmet etme duygusu yer almaktadır. Bölüm, öğrencilerin ve personelinin gelişimine önem vermekte ve onların bu değerleri benimsemelerini teşvik etmektedir.