Atatürk Üniversitesi Mikrobiyoloji bölümünün kuruluş tarihi oldukça eskilere dayanmaktadır. Bölümün kurulduğu yıllarda mikrobiyoloji alanında yapılan çalışmalar sınırlıydı ancak zaman içinde bölüm önemli bir gelişim gösterdi.

Bölümün kuruluş amacının toplumun mikrobiyoloji alanındaki ihtiyaçlarını karşılamak ve bu alanda yetişmiş eleman yetiştirmek olduğu söylenebilir. Mikrobiyoloji bölümünün kurulmasının ardından çeşitli alt dallara ayrılarak daha spesifik konularda eğitim verilmeye başlandı.

Bölümün gelişiminde önemli bir rol oynayan akademisyenler ve idareciler sayesinde mikrobiyoloji alanında önemli çalışmalar yapıldı. Bölüm, mikrobiyoloji alanındaki gelişmelere paralel olarak sürekli kendini yenileyerek öğrencilere güncel bilgileri vermeye devam etti.

Atatürk Üniversitesi Mikrobiyoloji bölümünün tarihçesi, mikrobiyoloji alanındaki gelişmelerin yanı sıra ülkemizdeki bilim ve eğitim dünyasının gelişim sürecini de yansıtmaktadır. Bölümün geçmişinden gelen birikim ve tecrübe, bugün daha güçlü bir şekilde eğitim ve araştırma faaliyetlerini sürdürmesini sağlamıştır.